分子生物化學實驗室

       主持人:黃晟洋 (Huang, Cheng-Yang)  Ph.D.

                   

        中山醫學大學生物醫學系 副教授

                  Advances in Biology, 編輯 (Editor, in Biochemistry area)

                    BioMed Research International, 專刊主編 (Lead Editor) 

                       E-mail: cyhuang@csmu.edu.tw    ;   Tel: (04)24730022 ext 11472

              

    本實驗室相信要做出好的研究最需要的就是好的 研究人力與好的實驗室討論與研究風氣本實驗室徵求欲研究下列各項生

物醫學主題之專題生與研究生: a. 利用分子結構與反應機制來研究抗生素與抗癌劑新標的 b. 利用化學生物學來研究各項蛋白質

後修飾的機制與意義 c. 各種活性胜肽與蛋白質藥物之開發 d. 超高速反應酵素之篩選與創造。 目前數個應用於產業的研究計畫

包括製造與結構設計用於醫美產業的蛋白質水解酶與神經阻斷酶以及用於新藥開發的數種新型酵素與生物觸酶。

        所有進入本實驗室的人員都將會受到應有的照顧與此專業領域上的訓練老師十分歡迎各位同學先以e-mail約定再前來面談

 學經歷

 2011.08-迄今     中山醫學大學/生物醫學系/副教授

 2013.12-2014.11   BioMed Research International/ 專刊主編 (Lead Editor)

 2013.06-迄今       Advances in Biology/ 期刊編輯

 2008.02-2011.07  中山醫學大學/生物醫學系/助理教授

 2007.08-2008.01  中央研究院/生命科學組/博士後獎助學者

 2007.08-2008.01  台北教育大學/自然科學系/兼任助理教授

 2003.09-2008.01  中央研究院/分子生物研究所/博士後研究

 1999.09-2003.09  國立交通大學/生物科技系/博士                   

 研究領域

      蛋白質藥物化學酵素與蛋白質化學蛋白質工程學分子生物學結構生物學標靶結構輔助組合式生物製藥生物有機合成學生物物理化學

 計畫執行

 102年度  1. 國科會 大專生研究計畫: DnaD與DNA結合模式之研究(102-2815-C-040-016-B)
          2. 國科會 大專生研究計畫: 黃酮醇、Zidovudine與Ticagrelor對PriA與DnaB解旋酶的抑制機制與藥物優化(102-2815-C-040-014-B)

          3. 國科會 專題研究計畫: DnaT與DNA結合性質之研究(NSC 102-2320-B-040-019)

 101年度  1. 國科會 大專生研究計畫: 利用螢光共振能量轉移法高速篩選金黃色葡萄球菌DnaB與PriA解旋酶的抑制劑 (101-2815-C-040-024-B)

          2. 國科會 大專生研究計畫: 原核與真核尿囊素水解酵素的比較:金屬結合位與轉譯羧化後修飾之分析 (101-2815-C-040-025-B)

 100年度  1. 國科會 基因體醫學國家型科技計畫: 抑制克雷伯氏菌複製叉重啟活性之研究 (NSC 100-3112-B-040-001)

  99年度  1. 國科會 基因體醫學國家型科技計畫: 阻斷克雷伯氏菌複製叉重啟之研究 2/2 (NSC 99-3112-B-040-001)

          2. 國科會 大專生研究計畫: 沙門氏菌的引子合成體組裝-PriA與PriB間的交互作用 (99-2815-C-040-014-B)

  98年度  1. 國科會 基因體醫學國家型科技計畫: 阻斷克雷伯氏菌複製叉重啟之研究 1/2 (NSC 98-3112-B-040-001)

          2. 國科會 大專生研究計畫: 克雷白氏肺炎桿菌的引子合成體組裝-DnaT與PriB間的交互作用 (98-2815-C-040-042-B)

          3. 國科會 大專生研究計畫: 解旋酶與引子合成酶間的交互作用 (98-2815-C-040-043-B)

          4. 彰化基督醫院腫瘤科合作計畫

  97年度  1. 中山醫學大學: 新進教師研究計畫

          2. 國科會 DnaD 與 DNA 結合性質之研究 (NSC 97-2311-B-040-001)

 學術演講獲獎擔任期刊與計畫審查委員

 2014.04.09  論文評審委員 for African J. Microbiology Research

 2014.04.07  論文評審委員 for J. Ancient Diseases and Preventive Remedies

 2014.03.03  國科會專題計畫 審查委員

 2014.01.22  複審委員 for 論文競賽/ 第22屆細胞及分子生物新知研討會

 2014.01.06  論文評審委員 for PLoS ONE

 2013.12.18  論文評審委員 for Sensors

 2013.10.11  論文評審委員 for PLoS ONE

 2013.09.30  論文評審委員 for BBA-Proteins and Proteomics

 2013.09.03  論文評審委員 for Biochimie

 2013.08.23  論文評審委員 for BMC Biochemistry 

 2013.07.      國科會大專生研究創作獎指導教授

 2013.06.      期刊編輯 for Advances in Biology

 2013.05.21  論文評審委員 for Biochimie

 2013.04.11  論文評審委員 for PLoS ONE

 2013.02.08  論文評審委員 for Sensors

 2012.05.28  論文評審委員 for Biocatalysis and Biotransformation

 2012.02.16  慈惠醫專研究計畫 審查委員

 2011.12.30  慈惠醫專研究計畫 審查委員

 2011.03.10  國科會99年度大專校院獎勵特殊優秀人才

 2010.12.02  慈惠醫專研究計畫 審查委員

 2010.09.23  中山醫大附設醫院計畫 審查委員

 2010.02.06  國科會專題計畫 初審委員

 2010.01.21  國立自然科學博物館

                     如何設計抗流感藥物:淺談從蛋白質結構看藥物研發

 2010.01.01  生物物理學協會會員 (Member for Biophysical Society)

 2009.06.21  論文評審委員 for MBE (Molecular Biology and Evolution)

 2009.04.09  論文評審委員 for MBE (Molecular Biology and Evolution)

 2008.10.23 國立台灣大學動物科技系

 2008.05.02 國立成功大學化學系

 2007.11.30 國立中正大學化學工程系

 2007.06.05 國立中央大學生命科學系

 參與教學課程

 大學部-蛋白質化學酵素學藥物化學概論分子生物學生物技術學生 醫科學概論普通生物學

          書報討論文獻討論生醫學生的職涯規劃專題研究實驗、 生醫藥妝品學與技術

 研究所-分子醫學生物分子結構特論生醫藥物設計學蛋白質體學專題討論

 研究成果

  1. Huang, C.Y.* (2014) Structural insight into the primosome assembly. Editor's contribution to BioMed Res Int. Manuscript in preparation. (SCI)

  2. Peng, W.F., Huang, C.Y.* (2014) Allantoinase and dihydroorotase binding and inhibition by flavonols and the substrates of cyclic amidohydrolases. Biochimie, 101, 113-122. (SCI)

  3. Huang, Y.H., Lin, M.J., Huang, C.Y.* (2013) DnaT is a single-stranded DNA binding protein. Genes Cells, 18, 1007-1019. (SCI)

  4. Huang, Y.H., Huang, C.Y.* (2013) The N-terminal domain of DnaT, a primosomal DNA replication protein, is crucial for PriB binding and self-trimerization. Biochem. Biophys. Res. Commun., 442, 147-152. (SCI)

  5. Ho, Y.Y., Huang, Y.H., Huang, C.Y.* (2013) Chemical rescue of the post-translationally carboxylated lysine mutant of allantoinase and dihydroorotase by metal ions and short-chain carboxylic acids. Amino Acids, 44, 1181-1191. (SCI)

  6. Huang, Y.H., Lin, M.J., Huang, C.Y.* (2013) Yeast two-hybrid analysis of PriB-interacting proteins in replication restart primosome: a proposed PriB-SSB interaction model. Protein J., 32, 477-483. (SCI)

  7. Huang, Y.H., Lo, Y.H., Huang, W., Huang, C.Y.* (2012) Crystal structure and DNA-binding mode of Klebsiella pneumoniae primosomal PriB protein. Genes Cells, 17, 837-849. (SCI); this article was also selected in World Biomedical Frontiers (2013) Infection and Immunity, 11, 17 (ISSN 2328-0166). 

  8. Lin, H.H., Huang, C.Y.* (2012) Characterization of flavonol inhibition of DnaB helicase: real-time monitoring, structural modeling, and proposed mechanism. J. Biomed. Biotechnol., 2012, 735368. (SCI)

  9. Huang, Y.H., Huang, C.Y.* (2012) Characterization of a single-stranded DNA binding protein from Klebsiella pneumoniae: mutation at either Arg73 or Ser76 causes a less cooperative complex on DNA. Genes Cells, 17, 146-157. (SCI)

  10. Huang, Y.H., Lin, H.H., Huang, C.Y.* (2012) A single residue determines the cooperative binding property of a primosomal DNA replication protein, PriB, to single-stranded DNA. Biosci. Biotechnol. Biochem., 76, 1110-1115. (SCI)

  11. Huang, C.Y.* (2012) Determination of the binding site-size of the protein-DNA complex by use of the electrophoretic mobility shift assay, an invited review in a book chapter: Stoichiometry and Research - The Importance of Quantity in Biomedicine (ISBN 978-953-51-0198-7), Chapter 10, pp. 235-242, edited by Innocenti, A., InTech Press Inc.

  12. Ho, Y.Y., Hsieh, H.C., Huang, C.Y.* (2011) Biochemical characterization of allantoinase from Escherichia coli BL21. Protein J., 30, 384-394. (SCI)

  13. Huang, Y.H., Lee, Y.L., Huang, C.Y.* (2011) Characterization of a single-stranded DNA binding protein from Salmonella enterica serovar Typhimurium LT2. Protein J., 30, 102-108. (SCI)

  14. Hsieh, H.C., Huang, C.Y.* (2011) Identification of a novel protein, PriB, in Klebsiella pneumoniae. Biochem. Biophys. Res. Commun., 404, 546-551. (SCI)

  15. Chen, C.C., Huang, C.Y.* (2011) Inhibition of Klebsiella pneumoniae DnaB helicase by the flavonol galangin. Protein J., 30, 59-65. (SCI)

  16. Jan, H.C., Lee, Y.L., Huang, C.Y.* (2011) Characterization of a single-stranded DNA-binding protein from Pseudomonas aeruginosa PAO1. Protein J., 30, 20-26. (SCI)

  17. Wang, C.C., Tsau, H.W., Chen, W.T., Huang, C.Y.* (2010) Identification and characterization of a putative dihydroorotase, KPN01074, from Klebsiella pneumoniae. Protein J., 29, 445-452. (SCI)

  18. Lo, Y.H., Tsai, K.L., Sun, Y.J., Chen, W.T., Huang, C.Y., Hsiao, C.D. (2009) The crystal structure of a replicative hexameric helicase DnaC and its complex with single-stranded DNA. Nucleic Acids Res., 37, 804-814. (SCI).

  19. Huang, C.Y., Hsu, C.C., Chen, M.C., Yang, Y.S. (2009) Effect of metal binding and posttranslational lysine carboxylation on the activity of recombinant hydantoinase. J. Biol. Inorg. Chem., 14, 111-121. (SCI)

  20. Huang, C.Y.*, Chang, Y.W., Chen, W.T. (2008) Crystal structure of the N-terminal domain of Geobacillus kaustophilus HTA426 DnaD protein. Biochem. Biophys. Res. Commun., 375, 220-224. (SCI)

  21. Tsai, K.L., Sun, Y.J., Huang, C.Y., Yang, J.Y., Hung, M.C., Hsiao, C.D. (2007) Crystal structure of the human FOXO3a-DBD/DNA complex suggests the effects of post-translational modification. Nucleic Acids Res., 35, 6984-6994. (SCI)

  22. Huang, C.Y., Hsu, C.H., Sun, Y.J., Wu, H.N., Hsiao, C.D. (2006) Complexed crystal structure of replication restart primosome protein PriB reveals a novel single-stranded DNA binding mode. Nucleic Acids Res., 34, 3878-3886. (SCI)

  23. Tsai, K.L., Huang, C.Y., Chang, C.H., Sun, Y.J., Chuang, W.J., Hsiao, C.D. (2006) Crystal structure of the human FOXK1a/DNA complex and its implications on the diverse binding specificity of winged helix/forkhead proteins. J. Biol. Chem., 281, 17400-17409. (SCI)

  24. Huang, C.Y., Yang, Y.S. (2005) Discovery of a novel N-iminylamidase activity: substrate specificity, chemicoselectivity and catalytic mechanism. Protein Expr. Purif. 40, 203-11. (SCI)

  25. Liu, J.H., Chang, T.W., Huang, C.Y., Chen, S.U., Wu, H.N., Chang, M.C., Hsiao, C.D. (2004) Crystal structure of PriB, a primosomal DNA replication protein of Escherichia coli. J. Biol. Chem. 279, 50465-71. (SCI)

  26. Huang, C.Y., Chao, Y.P., Yang, Y.S. (2003) Purification of industrial hydantoinase in one chromatographic step without affinity tag. Protein Expr. Purif. 30, 134-139. (SCI)

  27. Huang, C.Y., Chiang, S.K., Yang, Y.S., Sun, Y.J. (2003) Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of thermophilic imidase from pig liver. Acta Crystallogr. D. Biol. Crystallogr. 59, 943-945. (SCI)

  28. Huang, C.Y., Yang, Y.S. (2003) A novel cold-adapted imidase from fish Oreochromis niloticus that catalyzes hydrolysis of maleimide. Biochem. Biophys. Res. Commun. 312, 467-472. (SCI)

  29. Huang, C.Y., Yang, Y.S. (2002) The role of metal on imide hydrolysis: metal content and pH profiles of metal ion-replaced mammalian imidase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 297, 1027-1032. (SCI)